旋轉系統的質量不平衡是引起振動的主要原因，導致離心機破壞的諸多因素中，轉子裝載不平衡測試或試管插放不對稱是常見原因。區帶轉子不需要平衡，但在裝樣和取樣過程中，一定要保證轉子平衡這就要保證整個管路暢通，使分配到每個扇形室里的梯度液、樣品均勻等。角轉子和甩開轉子要求把離心管、套管、樣品及管帽一起放在天平進行稱重平衡。

　　

　　典型是在超速離心機使用中成功地使用垂直轉子(包括角轉子)的關鍵在于密封離心管。在垂直轉子的離心過程中，管帽要受到管內液體的壓力，除了保證密封良好外還要保證不銹鋼制品管帽、離心管與轉子的配合，使管內的空氣量減少，才能使離心管的塌陷程度降小。　　

　　引起轉子不平衡的原因

　　

　　轉子在旋轉過程中，其中心往往繞某一圓心轉動，產生同步圓心轉動，既進動。其產生的原因在于：設計不周而工作轉速比較接近，轉子(包括被離心樣品)存在偏心等。操作不當也可引起轉子的不平衡而產生進動，有以下幾種情況。

　　

　　1、雖然試管是對稱放置，但對應管內所裝溶液的密度不同，導致相對的兩管內所含物質質量分布有差別。

　　

　　2、安裝轉子的方法不正確，特別是轉子粘在主軸上時，絕不能用硬物敲擊或與轉軸成一定角度的力拽拉轉子。

　　

　　3、在旋轉過程中，由于轉動件的磨損與變形等會造成安裝偏心。

　　

　　4、維護檢修時，更換的零件和原有零件在重量、安裝部位上有差異，或碰撞轉動中的轉子也會使轉子轉動不穩定。